Emilija Mustapić Malenica rođena je 20. svibnja 1988. godine u Mostaru, Bosna i Hercegovina. Osnovnoškolsko obrazovanje završila je u Opuzenu, a srednju školu u jezičnoj gimnaziji u Metkoviću. U srpnju 2011. godine završava diplomski studij engleskog jezika i književnosti i geografije na Sveučilištu u Zadru. Tijekom studija bila je dobitnica niza nagrada za izvrsnost. U studenom 2014. godine upisuje Poslijediplomski doktorski studij lingvistike na Sveučilištu u Zagrebu, a u listopadu 2021. godine brani doktorski rad pod naslovom Uloga koverbalnih gesta u jezičnoj recepciji (mentorica: prof. dr. sc. Vlasta Erdeljac), čime stječe akademski stupanj doktorice znanosti.

Radila je jedno vrijeme kao nastavnica engleskog jezika u Hotelijersko-turističkoj i ugostiteljskoj školi Zadar, u jednoj školi stranih jezika te u pučkom otvorenom učilištu. U ožujku 2013. godine zaposlila se u svojstvu asistentice na Veleučilištu u Karlovcu, gdje je izvodila nastavu iz engleskog kao jezika struke na stručnom studiju Mehatronike, Sigurnosti i zaštite na radu te Ugostiteljstva. Na Sveučilištu u Zadru počela je raditi u studenom 2015. godine kao lektorica na Odjelu za anglistiku. Izvodi nastavu iz kolegijâ Suvremeni engleski jezik I-VIII, na prijediplomskoj i diplomskoj razini studija. Na istom je odjelu izabrana u nastavno zvanje više lektorice u veljači 2021. godine te u nastavno zvanje lektorice savjetnice u srpnju 2026. godine. Od akademske godine 2023./24. radi kao vanjska suradnica na diplomskom studiju Kliničke lingvistike i fonetike na Filozofskom fakultetu Sveučilišta u Zagrebu, gdje izvodi nastavu iz kolegija Multimodalni pristupi komunikaciji u kliničkoj lingvistici i fonetici.

Redovito se stručno i znanstveno usavršava sudjelovanjem i izlaganjem na domaćim znanstvenim konferencijama i inozemnim skupovima. Bila je članica organizacijskog i znanstvenog odbora nekoliko međunarodnih konferencija. Znanstveno se usavršavala na Odsjeku za psihologiju i jezične znanosti sveučilišta University College London (UK), u sklopu Erasmus+ programa mobilnosti (veljača 2018. godine). Bila je stručna suradnica na dvama kompetitivnim znanstvenoistraživačkim projektima: LanGuide: Language guidance tool for improving language knowledge, koji se financirao iz sredstava programa Erasmus+ (Call 2019 Round 1 KA2 – Cooperation for innovation and the exchange of good practices, KA203 – Strategic Partnership for higher education, 2019.–2022.) te na projektu Sveučilišta u Zadru, PROVIZENG: Procesiranje višerječnih izraza u engleskom kao stranom jeziku (1. 10. 2023. – 30. 9. 2025.). Područja njezina znanstvenog interesa uključuju psiholingvistiku, multimodalnu i neverbalnu komunikaciju, kliničku lingvistiku te poučavanje jezika. Redovito sudjeluje u aktivnostima popularizacije znanosti.